Pěstování cukrové kukuřice může být ohroženo ve chvíli, kdy na blízkém poli roste kukuřice krmná. Pokud je vzdálenost mezi těmito rostlinami menší než 100 metrů, mohou se tyto rostliny mezi sebou opylovat a cukrová kukuřice ztratí některé ze svých vlastností. Aby k tomuto problému nedocházelo, je možné začít cukrovou kukuřici pěstovat později než tu krmnou, nebo vyřešit problém posunutím záhonu s cukrovou kukuřicí co nejdále od kukuřice krmné.